Az Escherichia coli (E. coli) a fakultatív anaerobok közé sorolható. Ez azt jelenti, hogy bár az E. coli képes túlélni oxigén jelenlétében (aerob körülmények), oxigén hiányában is életben marad (anaerob körülmények). Aerob körülmények között az E. coli sejtlégzést végez, amely folyamat oxigént használ a szerves vegyületek lebontására és energiatermelésre. Ha nincs jelen oxigén, az E. coli átválthat fermentációra, amely folyamat a szerves vegyületeket oxigén felhasználása nélkül bontja le, és energiát állít elő ATP formájában. Fakultatív anaerobként az E. coli képes alkalmazkodni a különböző környezetekhez, és a rendelkezésre álló leghatékonyabb energiatermelési útvonalat használja.
