A PCOS-ben szenvedő nőknél magasabb lehet bizonyos hormonok, például az androgén szintje, ami befolyásolhatja a női magzat reproduktív rendszerének fejlődését. Ez olyan állapotokhoz vezethet, mint a policisztás petefészek szindróma vagy más hormonális egyensúlyhiány egy nőstény csecsemőnél későbbi életében. Ezek azonban nem tekinthetők a hagyományos értelemben vett születési rendellenességeknek.
Fontos, hogy a PCOS-ben szenvedő nők megfelelő prenatális gondozásban és felügyeletben részesüljenek a terhesség alatt, hogy a lehető legjobb eredményeket biztosítsák maguknak és csecsemőiknek egyaránt.