A kapillárisokat egyetlen réteg endothelsejtek bélelik, amelyek elég vékonyak és porózusak ahhoz, hogy lehetővé tegyék a kis molekulák, például oxigén, szén-dioxid, víz és glükóz diffúzióját. Az endothelsejtekben hormonok és más jelzőmolekulák receptorai is vannak, ami lehetővé teszi számukra, hogy szabályozzák az anyagok cseréjét a kapillárisfalon keresztül.
A kapillárisok felelősek a folyadéknak a vérből a környező szövetekbe történő szűréséért is. Ezt a folyamatot ultraszűrésnek nevezik, és a vér és a szövetek közötti hidrosztatikus nyomásgradiens hajtja. A hidrosztatikus nyomás nagyobb az erekben, mint a szövetekben, ezért a folyadék kiszorul a kapillárisokból és bejut a szövetekbe.
A kapillárisok felelősek a folyadéknak a szövetekből a vérbe való visszaszívásáért is. Ezt a folyamatot abszorpciónak nevezik, és a vér és a szövetek közötti ozmotikus nyomásgradiens hajtja. Az ozmotikus nyomás nagyobb az erekben, mint a szövetekben, ezért a szövetekből a folyadék visszaszívódik a kapillárisokba.
A kapillárisok létfontosságú szerepet játszanak a vér és a szövetek közötti folyadékegyensúly fenntartásában. Szerepük van a tápanyagok és salakanyagok cseréjében is a vér és a szövetek között.