Az orvosok használat előtt általában nem merítik folyadékba a hőmérőket. Egyes hőmérők, különösen a testhőmérséklet mérésére használt hőmérők, rendelkezhetnek szonda fedelével vagy eldobható szonda fedelével, amelyet használat előtt eltávolítanak. Ez segít megelőzni a kórokozók és fertőzések terjedését. Az orvosok fertőtlenítő törlőkendőket vagy más módszereket is használhatnak a hőmérő szondájának tisztítására minden használat előtt és után.
