Ahogy a neve is sugallja, A Huntington-kór az ezzel a mutációval kapcsolatos betegség. Ez egy autoszomális domináns neurodegeneratív rendellenesség, amelyet önkéntelen mozgások, kognitív zavarok és pszichiátriai zavarok jellemeznek. A kibővített CAG ismétlődés egy mutáns huntingtin fehérje termelődését eredményezi, amely abnormális funkcióval rendelkezik, és felhalmozódik az idegsejtekben, ami neurotoxicitáshoz és sejthalálhoz vezet.