A gyomornedv egy pepszin néven ismert proteáz enzimet tartalmaz, amely a fehérjék emésztéséért felelős a gyomorban. A pepszin a gyomor savas környezetében a legaktívabb, optimális pH-értéke 1,5 és 2,5 között van. A fehérjéket kisebb peptid-fragmensekre bontja, ezzel beindítja a fehérjeemésztési folyamatot.