Az emésztés harmadik szakasza a felszívódás, amely akkor kezdődik, amikor a táplálék bejut a vékonybélbe. A vékonybél egy hosszú, tekercses cső, amely a táplálékból származó tápanyagok nagy részéért felelős. A vékonybél falát apró bolyhok bélelik, amelyek ujjszerű kiemelkedések, amelyek növelik a bél felületét és segítik a tápanyagok felszívódását. A bolyhokat mikrobolyhok borítják, amelyek még kisebb kiemelkedések, amelyek tovább növelik a bél felületét.
A tápanyagok élelmiszerből történő felszívódása az aktív transzportnak nevezett folyamaton keresztül történik. Az aktív transzport energiát igényel ATP formájában, hogy a tápanyagokat a vékonybél lumenéből a véráramba juttassák. A vékonybélben felszívódó tápanyagok közé tartoznak a szénhidrátok, fehérjék, zsírok, vitaminok és ásványi anyagok.