Amikor a B-limfociták az emésztőrendszerben maradnak, plazmasejtekké differenciálódhatnak, amelyek antitesteket termelnek. Ezek az antitestek kötődhetnek az emésztőrendszerben lévő antigénekhez, például azokhoz, amelyek a baktériumokon vagy az élelmiszer-részecskéken találhatók. Ez a kötődés az immunrendszer aktiválásához vezethet, ami gyulladáshoz és az emésztőrendszer károsodásához vezethet. Ezt az állapotot gyulladásos bélbetegségnek (IBD) nevezik.