A paraffinolaj gyúlékony és alacsony lobbanáspontja van (általában 200°C körül van), ezért általában nem tekinthető biztonságosnak az autoklávban való elhelyezése. A paraffinolaj gőze is robbanásveszélyes légkört hozhat létre, ha hőforrással érintkezik. Ezenkívül a paraffinolaj oxigénnel reagálva peroxidokat képezhet, amelyek ütésérzékenyek és robbanásveszélyesek lehetnek.
Gyúlékonysága és egyéb veszélyes tulajdonságai miatt a paraffinolaj autoklávozása nem javasolt és kerülendő. Helyette alternatív módszereket kell alkalmazni az anyagok vagy berendezések sterilizálására vagy fertőtlenítésére.