* Genetikai rendellenességek azonosítása: Egyes genetikai rendellenességek, mint például a fenilketonuria (PKU) és a juharszirup vizeletbetegség, azonosíthatók bizonyos metabolitok szintjének mérésével a vérben vagy a vizeletben.
* Az egészségi állapot figyeléséhez: Az anyagcsere-szűrés felhasználható olyan egészségügyi állapotok nyomon követésére, mint a cukorbetegség, a vesebetegség és a májbetegség.
* A tápláltsági állapot értékeléséhez: Az anyagcsere-szűrés segítségével felmérhető egy személy tápláltsági állapota és azonosítható a tápanyaghiány.
* Droghasználat szűrése: Az anyagcsere-szűrés segítségével kimutatható a visszaélést okozó kábítószer a szervezetben.
Az anyagcsere-szűrést általában orvos vagy más egészségügyi szakember végzi. A vizsgálatokat orvosi rendelőben, kórházban vagy laboratóriumban lehet elvégezni.