A pepszin egy enzim, amely a gyomorban termelődik. Felelős a fehérjék kisebb peptidekre történő lebontásáért. A pepszin a gyomor savas környezetében a legaktívabb. A gyomor pH-ja jellemzően 1 és 2 között van. Ezért képes a pepszin olyan hatékonyan dolgozni a gyomorban.
Ha a gyomor pH-ja túl magas lesz, a pepszin nem tud megfelelően működni. Ez hipoklórhidriának nevezett állapothoz vezethet, amely olyan állapot, amelyben a gyomor nem termel elegendő sósavat. A hypochlorhydria számos problémához vezethet, beleértve az emésztési zavarokat, a felszívódási zavarokat és a baktériumok túlszaporodását.