Másrészről más tüskésbőrűek, mint például a tengeri uborka, más típusú emésztőrendszerrel rendelkeznek. Hosszú, felcsavarodott bélük van, amely áthalad a testükön. A bél arra specializálódott, hogy felszívja a tápanyagokat a lenyelt táplálékból. A tengeri uborka az üledékben található szerves anyagokkal táplálkozik, és emésztőrendszerük segíti ezen anyagok lebontását és felszívódását.
Általánosságban elmondható, hogy a tüskésbőrűek általános táplálékok, ami azt jelenti, hogy sokféle táplálékforrással rendelkeznek. Különböző fajok táplálkozhatnak algákkal, törmelékekkel, kis gerinctelenekkel vagy akár más tüskésbőrűekkel. Az egyes csoportok sajátos emésztőrendszeri adaptációi lehetővé teszik számukra, hogy különféle táplálékforrásokat aknázzanak ki, és életben maradjanak a megfelelő környezetükben.