Igen, az izopropil-alkohol alapú kézfertőtlenítők éppúgy működnek, mint az etilalkoholos fertőtlenítőszerek, és eltávolítják a legtöbb betegséget okozó mikroorganizmust a kezükről. Mind az izopropil-alkohol, mind az etil-alkohol hatékonyan roncsolja a mikroorganizmus sejtmembránjának legkülső rétegét alkotó foszfolipid kettős réteget, ami a mikroorganizmus halálához vezet. A Centers for Disease Control and Prevention (CDC) jelenleg etil- vagy izopropil-alkohol alapú kézfertőtlenítők használatát javasolja.