Az influenza-B vírusnak el kell jutnia a légzőrendszerhez, hogy túlélje. A légzőrendszer az influenzavírusok, köztük az influenza B elsődleges fertőzési helye. A vírus az orron vagy a szájon keresztül jut be a szervezetbe, és a légutakon keresztül jut el, ahol megfertőzi az orr, a torok és a tüdő sejtjeit. A vírus ezekben a sejtekben szaporodik, és az influenza tüneteit, például lázat, köhögést, torokfájást és orrfolyást okoz.