agaróz gélt öntöttünk könnyen használható és a mintákat lehet könnyen vissza. A gél is igen módosítható , hogy növelje a távolságot a kis és nagy DNS molekulák . Mivel készült cukor jelen van hínár , agaróz olcsóbb, mint alternatívák , és a biztonságosabb gél termék használható elektroforézis .
Akrilamid gélen
Mint agaróz, akrilamid könnyen módosítható . A nagyobb teherbírás , fut több minta azonos . Ez a fő előnye az, hogy az akrilamid agaróz van kisebb pórusokat, így jobban megfelel a kisebb DNS molekulák elválasztására , hogy agaróz gél nem lenne képes szétválasztani . Azonban bugyborékoló egy nagyobb probléma akrilamid , és mivel az akrilamid egy idegméreg , akkor nagyon veszélyes lehet dolgozni .
Kapilláris elektroforézis
Mivel a hő szertefoszlik gyorsan a polimer , kapilláris elektroforézis kevesebb időt vesz igénybe , mint a zselék , perc, illetve óra . Is, hiszen az eredmények elektronika felügyeli az egész folyamat automatizálható . Azonban a kapilláris elektroforézis nem tudja futtatni , mint sok minta ugyanabban az időben, mint gélek , és a gépek ( ára több mint $ 100,000 per egység) és reagensek lényegesen többe , mint a gél módszer az elkülönülés , így a legtöbb labor nem férnek hozzá a technológia .