Az emésztőenzimeket felszabadító folyamatot szekréciónak nevezik. A szekréció az a folyamat, amelynek során a sejtek anyagokat, például enzimeket, hormonokat vagy más molekulákat bocsátanak ki az extracelluláris környezetbe. Az emésztéssel összefüggésben az emésztőenzimeket az emésztőrendszer sejtjei választják ki, például a nyálmirigyek, a gyomor, a hasnyálmirigy és a vékonybél. Ezek az enzimek segítenek lebontani az élelmiszert kisebb molekulákra, amelyeket a szervezet fel tud venni.