Például az allogén csontvelő-transzplantáció során csontvelősejteket vesznek ki egy donortól, és olyan recipiensbe ültetik át, akinek az immunrendszere károsodott vagy sérült. Mivel a donor és a recipiens eltérő genetikai háttérrel rendelkezik, az átültetett csontvelőben lévő immunsejtek idegenként ismerhetik fel a recipiens szöveteit, és immunválaszt indíthatnak el a graft ellen. Ez az immunológiai inkompatibilitás graft-versus-host betegséghez (GVHD) vezethet, amely az allogén transzplantáció súlyos szövődménye.
A GVHD kockázatának minimalizálása és a sikeres graft átvétel biztosítása érdekében a donor és a recipiens gondos egyeztetése szükséges. Ez magában foglalja az olyan tényezők értékelését, mint a szöveti kompatibilitás (HLA-egyeztetés), a vércsoport-kompatibilitás és más genetikai markerek, hogy biztosítsák a lehető legjobb illeszkedést a recipiens számára.