* A halál okának megállapításához. Ez a boncolás leggyakoribb oka. Ha egy személy váratlanul vagy gyanús körülmények között hal meg, a boncolás segíthet meghatározni a halál okát és kizárni a rosszindulatú játékot.
* Információk gyűjtése a személy kórtörténetéről. A boncolás információt nyújthat a személy korábbi egészségügyi problémáiról, valamint minden olyan jelenlegi egészségügyi állapotról, amely hozzájárulhatott a halálához.
* A személy azonosításához. Egyes esetekben boncolásra lehet szükség az elhunyt személy azonosításához. Ez különösen fontos olyan esetekben, amikor a test súlyosan lebomlott vagy eltorzult.
* Bűnügyi nyomozáshoz szükséges bizonyítékok gyűjtése. Egyes esetekben boncolásra lehet szükség a nyomozáshoz szükséges bizonyítékok összegyűjtéséhez. Például boncolás végezhető annak megállapítására, hogy egy személyt meggyilkoltak-e, vagy ha baleset következtében halt meg.
A boncolást nem mindig végzik el. Egyes esetekben az elhunyt családja tiltakozhat a boncolás ellen. Más esetekben előfordulhat, hogy nincs szükség boncolásra, ha a halál oka már ismert.