Hogyan lehet átalakítani sorozattal Fasta

Egy közös cél, az orvosi kutatás magában foglalja azonosítása hibák vagy mutációk , a DNS-szekvencia , amely okozhat genetikai eredetű betegség . Technológia és számítástechnika fejlett genetikai kutatások arra a szintre , ahol több ezer szekvencia adatok elemezhető egyszerre. Egy kikötése újabb szoftver korábbi átalakítása szekvencia adatok FASTA formátumban. FASTA hasonló egyszerű szöveges formátumban. Ez lehetővé teszi több adattartalommal kell összeállítani egy fájlt, és gyorsítja elemzés . Azonban a legtöbb eszköz generálni sorrendben fájlok szöveges formátumban . Konvertálása szöveget FASTA formátum egy egyszerű folyamat, a szövegszerkesztő szoftver. Ez az, amire szüksége van
Computer
szövegszerkesztő programot

Show More utasítások
1

Nyissa ki a kijelölt DNS-szekvencia szöveges fájlt szövegszerkesztő programban . Ez lenne a szövegszerkesztő a Macintosh és a Note Pad a Windows kompatibilis rendszereket . Eredeti sorrend szöveges fájlokat lehet egy másik mellékre, például az azt követő az adatokat egy Applied Biosystems automata genetikai oldalon.
2

kezdődik az első sor beírásával> majd egy szekvencia azonosító. A nagyobb, mint a jel FASTA formátumú programok elemzésére FASTA adatokat. Nincsenek konkrét szabályokat az azonosítót , amíg nincsenek szóközök . Egy példa az elfogadható bejegyzés az első sor> Cat_Isomerase_Exon3 .
3.

Nyomja meg a " Return" gombot, hogy hozzon létre egy sortörés , és kezdődik a második sorban.

4

Kezdje szekvencia adatok a kettesen . FASTA formátumban iránymutatások előírják, DNS szöveges adatok alapján az alábbi Nemzetközi Uniója és Alkalmazott Kémia , IUPAC , kódokat. Minden sor legfeljebb 80 karakter a 80 DNS-bázisok , és lehet kis-vagy nagybetűvel . Elfogadható adatbevitel, beleértve a vegyes alapok is AGCTTCGTGG ... CVTGCGTTGT .
5

Nyomja meg a " Return" gombot, hogy elkezdje a következő sorban a szekvencia adatok . Minden sorban kell állnia a 80 bázisok által képviselt IUPAC -kódot.
6

Mentse a fájlt a txt fájl kiterjesztését, vagy megfelelő FASTA fájl kiterjesztése . Programok feldolgozó FASTA formázott adatok gyakran igényelnek FASTA adott mellékre, például az FSA Fna FFN vagy frn .