Az alacsony hCG-szintet és a menstruáció elmaradását okozhatja a nem normálisan fejlődő terhesség, például kémiai terhesség vagy méhen kívüli terhesség. Az alacsony hCG-szint másik gyakori oka az, hogy a terhesség nem tart a becsültnél messzebbre. Ez akkor fordulhat elő, ha a nő a vártnál később ovulál, vagy ha az embrió lassan növekszik. Ha a hCG-szint nagyon alacsony, ez annak a jele lehet, hogy a terhesség nem életképes. Ebben az esetben a szint végül leeshet, és a nő vérzést vagy pecsételést tapasztalhat.