A Lyme-kór kezelésére leggyakrabban használt antibiotikumok a doxiciklin és az amoxicillin. Ezeket az antibiotikumokat általában két-négy hétre írják fel, a fertőzés stádiumától függően. Egyes esetekben más antibiotikumok is alkalmazhatók, például cefuroxim vagy azitromicin.
Ha a betegséget korai stádiumban diagnosztizálják és kezelik (lokalizált fertőzés), a gyógyulási arány általában meglehetősen magas, gyakran közel 100%. Ha azonban a betegség a későbbi disszeminált stádiumba halad, a gyógyulási arány valamivel alacsonyabb lehet, de megfelelő antibiotikum terápia mellett jellemzően 80% feletti.
Fontos, hogy az orvos által felírt teljes antibiotikum-kúrát befejezzék, hogy biztosítsák a hatékony kezelést, és csökkentsék a fertőzés fennmaradásának vagy kiújulásának kockázatát. Ha a tünetek a kezdeti kezelés után is fennállnak, további vizsgálatra és további antibiotikum-kezelésre lehet szükség.
A kullancscsípés megelőzése és a rátapadt kullancsok azonnali eltávolítása csökkentheti a Lyme-kór elkapásának kockázatát. A rovarriasztó megfelelő használata, a kullancsokkal fertőzött területeken hosszú ujjú és nadrág viselése, valamint a kullancsok ellenőrzése a szabadban töltött idő után csökkentheti a fertőzés kockázatát és a kezelés szükségességét.