Nincs meghatározott hely a kromoszómákon, ahol a Crohn-betegség található. A Crohn-betegség egy összetett genetikai rendellenesség, amely több genetikai variáció és környezeti tényezők kölcsönhatásából ered. Míg a Crohn-betegséghez kapcsolódó számos genetikai változatot azonosítottak, ezek a különböző kromoszómák között szétszóródtak.
