Alultápláltság: A cöliákia károsítja a vékonybelet, amely felelős a tápanyagok táplálékból történő felszívásáért. Ennek eredményeként azoknál a cöliákiás betegeknél, akik nem követik a gluténmentes diétát, alultápláltság alakulhat ki. Ez számos problémához vezethet, beleértve a fáradtságot, a fogyást, a hasmenést és a vérszegénységet.
Osteoporosis: A cöliákia megzavarhatja a kalcium és a D-vitamin felszívódását, amelyek elengedhetetlenek a csontok egészségéhez. Ennek eredményeként a cöliákiában szenvedőknél fokozott a csontritkulás kialakulásának kockázata, amely állapot a csontok gyengülését és törékennyét okozza.
Tehetetlenség: A cöliákia károsíthatja a nemi szerveket, így férfiaknál és nőknél egyaránt meddőséghez vezethet.
Autoimmun betegségek: A cöliákia egy autoimmun betegség, ami azt jelenti, hogy a szervezet immunrendszere megtámadja saját szöveteit. A cöliákiában szenvedőknél nagyobb a kockázata más autoimmun betegségek, például az 1-es típusú cukorbetegség, a pajzsmirigybetegség és a rheumatoid arthritis kialakulásának.
Rák: A cöliákia bizonyos ráktípusok, köztük a limfóma, a vékonybélrák és a vastagbélrák fokozott kockázatával jár.