Ezenkívül a nehéz láncok konstans régiói különböznek az IgG és IgM antitestek között. Ezek a konstans régiók felelősek az antitestek effektor funkcióiért, mint például a komplement fehérjékhez vagy az immunsejtek Fc receptoraihoz való kötődésért. Az IgG és IgM antitestek konstans régióiban mutatkozó különbségek lehetővé teszik, hogy eltérő effektor funkcióval rendelkezzenek.
Például az IgG antitestek komplement fehérjékhez kötődhetnek, és aktiválhatják a komplement kaszkádot, ami a célsejtek pusztulásához vezet. Az IgM antitestek nem tudnak kötődni a komplement fehérjékhez, de képesek kötődni az immunsejtek Fc receptoraihoz és aktiválni azokat, ami gyulladásos mediátorok felszabadulásához vezet.