A kémiai emésztés, a táplálék enzimek általi lebontása a szájüregben kezdődik a nyál amilázának keményítőkre gyakorolt hatására. Amint az élelmiszer eléri a gyomrot, gyomornedvvel találkozik, amely sósavat és pepszin enzimet tartalmaz. A sósav savas környezetet hoz létre, amely elpusztítja a mikroorganizmusokat és denaturálja a fehérjéket, így azok érzékenyebbek az enzimatikus lebontásra. A pepszin, egy aszparaginsav-proteáz, beindítja a fehérjék emésztését azáltal, hogy a fehérjéket kisebb peptidekre bontja.