Egyes műanyagok, mint például a polietilén-tereftalát (PET) és a polisztirol, káros vegyi anyagokat bocsáthatnak ki mikrohullámú sütőben hevítve. Ezek a vegyszerek bevándorolhatnak az élelmiszerekbe és italokba, és potenciálisan egészségügyi problémákat okozhatnak. Más műanyagok, mint például a polipropilén (PP) és a nagy sűrűségű polietilén (HDPE), általában biztonságosnak tekinthetők mikrohullámú sütőben.
Ha nem biztos abban, hogy egy műanyag edény mikrohullámú sütőben használható-e, a legjobb, ha kapcsolatba lép a gyártóval.