A benzalkónium-klorid egy kvaterner ammóniumvegyület, ami azt jelenti, hogy nitrogénatomot tartalmaz, amelyhez négy alkilcsoport kapcsolódik. Ez egy kationos felületaktív anyag, ami azt jelenti, hogy pozitív töltésű. A benzalkónium-klorid gyenge bázis, körülbelül 12 pKa-értékkel. Ez azt jelenti, hogy protont tud átadni egy erősebb bázisnak, de nem képes protont elfogadni egy gyengébb savból.
