Bár az aerob légzés a lovaglás során használt fő energiarendszer, az anaerob légzés is szerepet játszik, különösen intenzív mozgási kitörések esetén. Az anaerob légzés vagy fermentáció akkor következik be, amikor a szervezet oxigén nélkül bontja le a glükózt. Ez a folyamat gyorsan termel energiát, de tejsav felhalmozódását eredményezi, ami izomfáradtsághoz vezet. A lovaglás során azonban a tevékenységek intenzitása és időtartama általában nem elég magas ahhoz, hogy kizárólag az anaerob légzésre támaszkodjon.
Ezenkívül a lovakon lassabb tempójú lovaglás, például egy laza terepen való lovaglás során kisebb igénybevételt ró a szervezet energiarendszerére, ami lehetővé teszi, hogy jobban hagyatkozzon az aerob légzésre. Ezzel szemben az erőteljesebb tevékenységek, mint például a galoppozás vagy az ugrás, nagyobb energiakibocsátást igényelnek, mind aerob, mind anaerob légzéssel, hogy kielégítsék az érintett izmok energiaigényét.
Ezért, míg a lovaglás elsősorban aerob légzést foglal magában, az anaerob légzés az intenzívebb pillanatok vagy tevékenységek során jön szóba. Az energiarendszerek közötti egyensúly a lovaglás tempójától, intenzitásától és időtartamától függ.