Az ultrahangos képalkotást általában nem használják az agy részletes vizuális képeinek létrehozására. Az ultrahanghullámok nehezen hatolnak be a koponyán, ezért nehéz tiszta képet kapni az agy struktúráiról. Ehelyett az orvosi képalkotó technikákat, például a mágneses rezonancia képalkotást (MRI) és a számítógépes tomográfiás (CT) vizsgálatokat gyakran használják agyi képalkotáshoz, mivel kiválóan képesek részletes keresztmetszeti és háromdimenziós képeket készíteni az agyról.