A mokka frappét általában nem tekintik gluténmentesnek. Ennek az az oka, hogy jellemzően glutént tartalmazó összetevőket tartalmaznak, például búzalisztet vagy malátakivonatot. Egyes kávézókban és éttermekben azonban gluténmentes változatokat is kínálhatnak mokkás frappéik, ezért mindig érdemes megkérdezni a rendelés előtt.
Fontos, hogy a cöliákiában vagy glutén intoleranciában szenvedő egyének körültekintően járjanak el a mokka frappé fogyasztása során, és mindig tájékozódjanak az intézménynél termékeik gluténmentességéről.