Igen, súlyos és hosszan tartó pajzsmirigy-alulműködés esetén a pajzsmirigy végül teljesen leállhat, ami egy primer hypothyreosis nevű állapothoz vezethet. Ez akkor fordul elő, ha a pajzsmirigy nem képes önmagában elegendő pajzsmirigyhormont termelni, annak ellenére, hogy az agyalapi mirigyből megfelelő pajzsmirigy-stimuláló hormon (TSH) van jelen. Ha nem kezelik vagy rosszul szabályozzák, a súlyos hypothyreosis jelentős egészségügyi szövődményekhez és végső soron teljes pajzsmirigy-elégtelenséghez vezethet. Ezért kulcsfontosságú, hogy a hypothyreosisban szenvedő egyének megfelelő kezelésben részesüljenek és rendszeres monitorozásban részesüljenek, hogy megakadályozzák a pajzsmirigy-alulműködést.
