Az alvási migrént jellemzően az alvás során fellépő agyi változások okozzák. Ezek a változások magukban foglalhatják a trigeminus ideg aktivitásának növekedését, amely az arc érzéséért felelős. Ezeket a szerotonin és más neurotranszmitterek szintjének változása is okozhatja az agyban.
Az alvási migrén számos gyógyszerrel kezelhető, beleértve a fájdalomcsillapítókat, gyulladáscsökkentő szereket és epilepszia elleni szereket. Az életmódbeli változtatások, például bizonyos kiváltó tényezők elkerülése és az egészséges alvási ütemterv fenntartása szintén segíthetnek csökkenteni az alvási migrén kockázatát.