A köldökagenezis általában nem jár semmilyen más egészségügyi problémával, és nem igényel kezelést. Ez azonban egy mögöttes egészségügyi állapot jele lehet, mint például az omphalocele (a hasfal olyan hibája, amely lehetővé teszi a belek átnyúlását a köldökön) vagy gastroschisis (ritka állapot, amelyben a belek a testen kívül fejlődnek ki) . Ezekben az esetekben kezelésre lehet szükség.