A legtöbb baktérium hasznos. Valójában az összes baktériumnak csak körülbelül 1%-a patogén vagy betegséget okozó. A baktériumok túlnyomó többsége valójában hasznos, fontos szerepet tölt be a környezetben és a testünkben. Például a baktériumok segítenek a szerves anyagok lebontásában, a tápanyagok újrahasznosításában és az oxigéntermelésben. Segítenek továbbá az élelmiszer megemésztésében, a fertőzések leküzdésében és a vitaminok termelésében. Az anaerob baktériumok azok, amelyeknek nincs szükségük oxigénre a túléléshez. Egyes anaerob baktériumok jótékony hatásúak, például azok, amelyek segítik az étel megemésztését, míg mások kórokozók, például tetanuszt és botulizmust okozó baktériumok.
