Yersinia pestis , a pestist okozó baktériumot leggyakrabban rágcsálókkal, különösen vadon élő rágcsálófajokkal, például mormotákkal, mókusokkal és pocokokkal társítják. Ha ezek az állatok fertőzöttek, bolhafertőzés alakulhat ki bennük, amely aztán továbbadhatja a baktériumokat az embereknek. Így az Y. pestis elsődleges búvóhelye a rágcsálópopulációkban és a bolhákban van, amelyek hordozhatják a baktériumot. A rágcsálók elleni védekezés és megfigyelés létfontosságú a pestis terjedésének megakadályozásához.