Központi funkciója az immunrendszerben betöltött speciális szerepe körül forog.
Bár igaz, hogy a csecsemőmirigy a limfociták (immunsejt) fejlődésében való részvétele miatt rokon a nyirokszövetekkel, elsődleges fókusza a sejt által közvetített immunitás és az immuntolerancia kialakításának összetett mechanizmusain belül van.