A HIV elsősorban a CD4+ T-sejtnek nevezett fehérvérsejt-típust célozza meg és pusztítja el, vagy más néven segítő T-sejtet. Ezek a sejtek kritikus szerepet játszanak a szervezet immunrendszerében, elősegítve a fertőzések és betegségek elleni immunválasz koordinálását és megerősítését. A HIV megfertőzi ezeket a sejteket, és felhasználja őket a vírus replikációjára és további kópiák előállítására.
Míg a HIV különféle testnedvekben és szövetekben található, a nyirokrendszer és a nyirokcsomók különösen fontos helyei a HIV replikációjának és perzisztenciájának. A nyirokrendszer erek, szövetek és szervek hálózata, amely segít a folyadék elvezetésében a szövetekből, és döntő szerepet játszik az immunrendszer felügyeletében és válaszadásában. A nyirokcsomók kicsi, bab alakú struktúrák, amelyek az egész testben találhatók, és megszűrik és megfogják az idegen anyagokat, beleértve a vírusokat és baktériumokat.
A HIV-fertőzés korai szakaszában a vírus elsősorban a gasztrointesztinális traktus és a hüvely nyálkahártyájában található CD4+ T-sejteket célozza meg és szaporodik azokon belül. Azonban a fertőzés előrehaladtával és a krónikus fázisba, az AIDS-nek (szerzett immunhiányos szindrómának) nevezett HIV terjedésével az egész szervezetben, beleértve a nyirokrendszert is.
A CD4+ T-sejtek magas koncentrációja és az immunsejtek nyirokrendszeren belüli folyamatos recirkulációja ideális környezetté teszi a HIV replikációjához és terjedéséhez. A vírus megfertőzheti és elpusztíthatja a CD4+ T-sejteket a nyirokcsomókban, ami e kulcsfontosságú immunsejtek jelentős kimerüléséhez vezet. Ez a kimerülés gyengíti a szervezet immunrendszerét, és az egyéneket fogékonyabbá teszi a különféle opportunista fertőzésekre és betegségekre.