A gombák egyes esetekben szabad szemmel is láthatók. A nagyobb gombák, mint a gombák, pöfeteggombák és polcgombák, nagyítás nélkül is jól láthatóak. Sok gomba azonban mikroszkopikus méretű, és mikroszkópos megfigyelést igényel. Ide tartoznak az élesztőgombák, penészgombák és sokféle növényi kórokozó.
