* Funkcionális rendellenességek: Ezek olyan állapotok, amelyek befolyásolják az emésztőrendszer működését, de nem okozzák őket semmilyen alapbetegség. Ilyenek például az irritábilis bél szindróma (IBS), a Crohn-betegség és a fekélyes vastagbélgyulladás.
* Strukturális rendellenességek: Ezek olyan állapotok, amelyek befolyásolják az emésztőrendszer fizikai szerkezetét. Ilyenek például a sérvek, polipok és daganatok.
* Rosszindulatú betegségek: Ezek olyan rákos megbetegedések, amelyek az emésztőrendszerben kezdődnek. Ilyen például a nyelőcsőrák, a gyomorrák, a vastagbélrák és a végbélrák.