Laboratóriumi hiba előfordulhat a minták szennyeződése, helytelen kezelése vagy a DNS-minták helytelen értelmezése miatt. E kockázatok minimalizálása érdekében az apasági vizsgálati laboratóriumok szigorú protokollokat és minőség-ellenőrzési intézkedéseket követnek, hogy biztosítsák a vizsgálati eredmények pontosságát és megbízhatóságát. Az emberi tévedés lehetőségét azonban soha nem lehet teljesen kiküszöbölni.
Mintakeverés előfordulhat a DNS-minták gyűjtése vagy feldolgozása során. Alapvető fontosságú, hogy a megfelelő címkézési és dokumentációs eljárásokat kövesse a vizsgálati folyamat során, hogy elkerülhető legyen a félreértés vagy a minta téves azonosítása.
A DNS apasági vizsgálat pontossága a szolgáltatott DNS-minták minőségétől is függ. Olyan tényezők, mint a lebomlott DNS vagy az elégtelen mintamennyiség befolyásolhatják a vizsgálati eredmények megbízhatóságát. A pontos eredmények biztosítása érdekében kulcsfontosságú, hogy az egyének betartsák a vizsgálólaboratórium által a mintavétellel és -kezeléssel kapcsolatban adott konkrét utasításokat.
Fontos megjegyezni, hogy a DNS-apasági vizsgálat hibaaránya rendkívül alacsony, jellemzően kevesebb, mint 1%. Ha aggályok merülnek fel az apasági vizsgálat eredményének pontosságával kapcsolatban, további vizsgálat vagy szakértői konzultáció javasolható a megbízható következtetések levonására.