- Autoimmun betegségek: Egyes esetekben az immunrendszer tévedésből megtámadja és elpusztítja a csontvelőben lévő, vérsejteket termelő őssejteket.
- Vírusfertőzések: Egyes vírusok, mint például a hepatitis és a parvovírus, károsíthatják a csontvelőben lévő őssejteket.
- Bizonyos gyógyszerek és toxinok: Bizonyos gyógyszereknek, vegyszereknek vagy toxinoknak, például benzolnak és kemoterápiás gyógyszereknek való kitettség károsíthatja a csontvelőben lévő őssejteket.
- Sugárterápia: A csontvelő sugárkezelése károsíthatja az őssejteket és aplasztikus anémiához vezethet.
- Genetika: Vannak, akik genetikailag hajlamosak aplasztikus anémia kialakulására.
- Terhesség: Aplasztikus anémia ritkán fordulhat elő terhesség alatt az immunrendszer változásai miatt.