A testbe jutva a baktériumok eljutnak a tüdőbe, és elkezdenek növekedni. Méreganyagokat termelnek, amelyek károsítják a légutakat bélelő sejteket. Ez a károsodás a szamárköhögés jellegzetes tüneteit okozza, beleértve a súlyos köhögést, lázat és légzési nehézséget.
Egyes esetekben a szamárköhögés súlyos szövődményekhez, például tüdőgyulladáshoz, agyvelőgyulladáshoz és halálhoz vezethet. A szamárköhögés leggyakrabban gyermekeknél fordul elő, de felnőtteket is érinthet.