Nem, az acyclovir egy vírusellenes gyógyszer, és nem hatékony a bakteriális fertőzések ellen. A fogfertőzéseket jellemzően baktériumok okozzák, ezért az acyclovir nem lenne megfelelő kezelés. Az antibiotikumokat, például a penicillint általában a fogfertőzések kezelésére használják.