Míg az UPEC a húgyúti fertőzések leggyakoribb oka, más E. coli törzsek, amelyekből hiányoznak ezek a specifikus virulencia faktorok, alkalmanként szintén okozhatnak húgyúti fertőzést. Ezek a nem uropatogén E. coli törzsek húgyúti fertőzéseket okozhatnak olyan egyéneknél, akiknek legyengült immunrendszerük van, vagy olyan alapbetegségben szenvednek, amely megváltoztatja a húgyúti normál védekezőképességét.
Ezért nem minden UTI-t okozó E. coli törzs minősíthető uropatogénnek. Csak azok a törzsek tekinthetők uropatogén E. colinak, amelyek specifikus virulenciafaktorokkal rendelkeznek, és képesek húgyúti fertőzést okozni egyébként egészséges egyénekben.