Az autoimmun betegségek olyan rendellenességek csoportja, amelyekben a szervezet immunrendszere megtámadja saját szöveteit. A Hashimoto-féle pajzsmirigygyulladásban az immunrendszer megtámadja a pajzsmirigyet, amely a nyakban található, és az anyagcserét szabályozó hormonokat termel.