A molibdénnek még nagyon magas expozíció esetén sem ismert toxikus hatása az emberre. Bár vannak olyan állatkísérletek, amelyek kimutatták a toxicitást, az állatkísérletek nem jelezték előre a molibdén toxicitását emberben. A molibdén szintén nem genotoxikus, rákkeltő vagy teratogén. Ez azt jelenti, hogy nem okoz mutációkat, sejtdaganatokat vagy születési rendellenességeket.