Az embrió nemét a megtermékenyítés pillanatában határozzák meg. Ha a petesejtet megtermékenyítő sperma X-kromoszómát hordoz, az embrió nőstény lesz. Ha a spermium Y-kromoszómát hordoz, az embrió hímnemű lesz.
Számos módszer létezik az embrió nemének meghatározására. Az egyik módja a genetikai tesztelés. Ezt úgy lehet megtenni, hogy sejtmintát veszünk az embrióból, és elemezzük a kromoszómákat. Az embrió nemének meghatározásának másik módja az ultrahang. Ez egy nem invazív eljárás, amely hanghullámokat használ az embrió képeinek létrehozásához. Ha az embrió hím, az ultrahang kimutatja a pénisz jelenlétét. Ha az embrió nő, az ultrahang nem mutatja a pénisz jelenlétét.
Az embrió neme amniocentézissel is meghatározható. Ez egy olyan eljárás, amelyben egy tűt szúrnak a magzatvíz zsákba, és mintát vesznek a magzatvízből. A magzatvíz ezután megvizsgálható az SRY gén jelenlétére. Ha az SRY gén jelen van, az embrió hím. Ha az SRY gén nincs jelen, az embrió nőstény.
Az amniocentézis invazívabb eljárás, mint az ultrahang, és a vetélés kis kockázatával jár. Ez azonban egy pontosabb módszer az embrió nemének meghatározására.