1) Patogén kölcsönhatások: Egyes baktériumok emberi betegségeket okoznak, például tüdőgyulladást, tuberkulózist, kolerát és ételmérgezést.
2) Commensális kölcsönhatások: Más baktériumok az emberben vagy az emberben élnek anélkül, hogy kárt okoznának. Ezek a baktériumok részt vehetnek az emésztésben, a tápanyagszintézisben és a káros kórokozók elleni védelemben.
3) Kölcsönös interakciók: Más baktériumok is előnyösek az ember számára. Például egyes baktériumok segítik az embert az élelmiszer megemésztésében, antibiotikumok termelésében és a kártevők elleni védekezésben.
4) Környezeti kölcsönhatások: A baktériumok fontos szerepet játszanak a környezetben. Segítik a szerves anyagok lebontását, a tápanyagok újrahasznosítását és a nitrogén megkötését a légkörből.