A baktériumokkal ellentétben az archaeát nem hozták összefüggésbe azzal, hogy emberekben vagy más szervezetekben ismert betegségeket okozzon. Általában extrém környezetben, például forró forrásokban, savas tavakban és mélytengeri hidrotermális nyílásokban boldogulnak, ahol döntő szerepet játszanak a biogeokémiai folyamatokban.
Ezért, míg a baktériumok számos kórokozót foglalnak magukban, amelyek különféle betegségekért felelősek, az archaeákról nem ismert, hogy emberekben vagy állatokban betegségeket vagy betegségeket okoznának.