A vírusos szívizomgyulladás eseteinek túlnyomó többsége teljesen megszűnik a normális szívműködés helyreállásával. A prognózis általában jó, és a legtöbb ember teljesen felépül. Ritka esetekben azonban a szívizomgyulladás súlyos szövődményekhez vezethet, például szívelégtelenséghez, szívritmuszavarokhoz és hirtelen szívhalálhoz. A gyógyulási idő a fertőzés súlyosságától és az egyén általános egészségi állapotától függően változik. Az enyhe szívizomgyulladás általában néhány héten belül megszűnik, de a súlyosabb esetekben több hónapig vagy akár egy évig is eltarthat a teljes gyógyulás.